分子动力学与蒙特卡洛
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知识文档·分子模拟·蒙特卡洛·MolSimulX
经典 MD 主线走完后,常会碰到:要不要换一种采样方式?势能面上坑很多、势垒很高时,只靠牛顿方程往前蹭,可能一辈子困在一个坑里。
统计力学基础与系综 已说清:目标往往是系综平均;MD 用一条长轨迹的时间平均去估它(假定大致遍历)。还有一条路不跟物理时间走,而是按概率在构型之间跳——蒙特卡洛(Monte Carlo, MC)。再往「慢过程、稀有事件」走,还有带物理时间的 动力学蒙特卡洛(kinetic Monte Carlo, kMC),并常常和 MD 耦合使用。
本篇对照 MD / 平衡 MC / kMC,并讲常见耦合思路。全谱地图见 分子模拟方法概述。

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学习路径
前置阅读: 统计力学基础与系综 · 分子动力学模拟概述 · 分子模拟方法概述
下一步:
- 增强采样与自由能 —— 势垒高时的自由能与采样
- 朗之万、布朗与溶剂介质方法 —— 连续随机动力学另一条线
- 序参量与相变 —— 稳态 / 事件常用什么量标识
- 输运系数谱系 —— 仍需要连续动力学输运时
